朱由检将锦衣卫和东厂裁撤掉，让孙承宗在国防部下面设国安局，专门负责皇帝和重要官员的安保工作，内阁的部长和副部长级别干部，出门都由国安局派人保护。
朱由检派人从武当派弄来一群高手，其中有个少年叫王征南，年纪虽小，但武艺颇精，人也机灵，朱由检让他在自己身边做贴身护卫。
两人一起设计各部门的职责和权利，在这过程当中，朱由检发现李云崖懂得的真多，连一户农家每年花多少钱，一亩地产多少粮都知道，很多东西都让他觉得大开眼界，原来政府跟百姓之间的关系是这样的，下边的人如何逃税漏税，蕃台和臬台之间是如何相互勾结，军官又是如何抽取军饷……原本他两眼一抹黑，根本毫无头绪的奏折，到了李云崖这里，随便几句话就能解决。
他开始逐渐相信李云崖的话：一个生长在深宫里的人，是没办法治理好这样一个庞大的国家的，自己把权利都握在手里，不但自己活的累，国家也会被自己搞糟，历史上国家兴盛的朝代，很多时候都是名相掌权，皇上垂拱而治的时候，远有商鞅变法，近有张居正改革……
其实最打动他的，是李云崖说的这样一番话：“你就不想跟我出去走走？以后我要造铁壳的超级大船，比皇极殿还要大上许多倍！出海去朝鲜，去日本，去琉球，去爪哇，去印度，去非洲。去看黑人，看白人，吃香蕉、吃椰子、吃菠萝！难道你就愿意一辈子待在紫禁城里？不只是你，将来你的儿子，你的孙子，要么被圈禁在紫禁城里，要么被圈禁在封地，跟住监牢有什么不同？”
听李云崖说起海外风情，朱由检十分心动：“只是历来一国之君不能轻动……”
二十来岁的年轻人，谁不愿意出去走走？当年正德皇帝就呆不住，偷着跑出紫禁城到长城外面去跟蒙古人打仗，后来宁王造反把他高兴坏了，非要御驾亲征不可，刚走到半路，宁王就被王守仁擒住，正德皇帝就让王守仁赶紧把宁王放了，他要再打一次，臣子们都批判正德荒唐，实际上也正是从另一个方面反映出了作为皇帝的无奈。
“所以你要放权，你不能什么权利都抓着，那样你就会把自己圈禁在紫禁城里，把自己活活累死，国家也会每况愈下，你放下的越多，得到的也就越多。”
朱由检无法接受：“那我将帝位传给别人，岂不是更好？”
李云崖乐了：“你是怕臣子们造反吗？你千防万防，还不是有温体仁造你的反？你权利越大，他们越会造你的反，你如果给内阁总理足够多的权利，他们就都去争相当总理了，谁还冒着被抄家灭族的危险要当皇上？况且，枪杆子里面出政权，国防部还在你手里，还有监察部，专门考核监督百官的，有这两个部门在你手里，你还怕什么？”
朱由检沉思许久，最后点头道：“我明白了，书上写在董仲舒罢黜百家独尊儒术之前，汉朝都是以黄老之道治国，要皇帝无为而治，你是道家人，可是这个意思？”
“就是这个意思！”李云崖见朱由检自己找到圣贤经典依据，意外地高兴，“有时候无为比有为更好，你听我的，五年之后，不出十年，我保证带你出海，去看十来丈长的大鱼！”
“十来丈长？可是《庄子》上说的鲲？我们要去北海吗？”
“不只是北海，到时候我们哪里都可以去的！而且那东西在各个海域都有，还有好多好多的有趣的东西，你都看过一遍，才不枉了此生，否则只待在紫禁城里一辈子，国家还是千疮百孔一团糟，那又有什么趣味！”
李云崖没事就给朱由检讲海外的事情，潜移默化地影响，朱由检听得十分着迷，有时候真的恨不能立刻就去看看李云崖说的那种比皇极殿还要高的鹿，还有传说中的狻猊，肚子上有肉袋的大老鼠，新设立的部门，就在两人的努力之下，逐渐成型。
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